肿瘤基因检测可以帮助预测卵巢癌的预后

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预计到2020年,将有1,532名妇女被诊断出患有卵巢癌,今年将有1,068人死于该病。它的生存期很差,本文研究的类型-高度浆液性卵巢癌-是最常见和最差的生存类型。卵巢癌是女性中第八大最常见的癌症,2018年全球有近300,000例新病例。

大学的主要作者教授说:“我们对卵巢癌女性的3769份肿瘤样本进行了分析,发现我们能够可靠地利用一块肿瘤来确定女性在被诊断出五年后的生存机会。”

研究人员发现,与使用患者的年龄和癌症分期相比,他们的基因表达测试在预测存活率方面要好得多。

“将女性分为五组时,我们发现那些肿瘤基因表达与最佳预后相关的女性可以生存九年,而最贫困生存组的女性可以生存两年,这是非常大的差异。”教授说。

“我们的愿景是临床医生可以在诊断时使用我们的测试来识别在当前治疗方面效果不佳的患者群体,并有可能为他们提供替代方案-例如,我们可以将这些患者用于临床试验,向他们提供可以改善其生存率的不同治疗方法。”

在研究中,该团队使用了一组训练样本和一个测试样本-总共近4000个样本。

该论文的第一作者,大学的博士说:“使用新颖的统计方法,我们分析了六项先前的基因表达研究的数据,这些数据帮助我们鉴定了可能与高级别浆液性卵巢癌生存有关的基因。”

将大约500个候选基因组合在一起后,研究小组使用NanoString平台测量了4000个样品中的基因表达。

博士说:“为了预测基因表达的存活率,我们选择了四种机器学习方法中的一种,一种称为“弹性网”的方法,该方法在训练数据中表现最好。

教授说:“我们使用训练集来确定可以在预测中使用哪些基因,然后我们对其进行了测试,以查看是否在另一组中得到了相同的结果。”

教授是卵巢肿瘤组织分析样本来解决重要的临床问题,这些研究小组正在开展多个不同的大型项目。

她说:“该联盟在这个领域是独一无二的,因为它可以获取数千个样本-这是许多罕见疾病如卵巢癌的样本。”

“这就是使我们能够开发这种预后工具的原因-其他小组之前曾尝试过检查预后,但是临床上没有任何使用。目前,仅使用患者的年龄和阶段来确定存活率,因此类似我们的工具迫切需要的。”

南昌无痛人流医院指出研究人员说,他们选择了具有已知药物靶标的基因进行分析。

“我们确定的某些基因可以预测生存的好坏,这可能是新疗法的潜在靶标。目前,大多数卵巢癌患者都接受相同的治疗-他们所关注的不像乳腺癌或其他癌症您的肿瘤并从多种治疗方法中进行选择。因此,这是一种对患者进行分层并可能在未来提供更多个性化治疗的方法。”

为了进一步验证发现,研究团队希望将测试纳入前瞻性研究和临床试验中。

教授说:“有可能,我们可以将其纳入临床试验中,从而使预计存活率低的女性能够尽快获得替代治疗。”

研究人员希望他们的测试将在不久的将来为临床使用做好准备。